MetaMap安装和使用
1、需要先安装jdk,这个很容易找到教程例如https://www.linuxidc.com/Linux/2017-02/140908.htm
2、在UMLS(https://utslogin.nlm.nih.gov/cas/login?service=https%3a%2f%2fmmtx.nlm.nih.gov%2fdownload%2fpublic_mm_linux_javaapi_2016v2.tar.bz2)申请一个账号,需要审批,可能会隔一天审批通过。申请信息要仔细填,不然很容易不通过
3、从MetaMap官网(https://mmtx.nlm.nih.gov/JavaApi.shtml)下载安装包

4、将上面下载的两个压缩包解压tar -jxvf public_mm_linux_main_2016v2.tar.bz2tar 幻腾寂埒-jxvf public_mm_javaapi_2016v2.tar.bz2解压后都是public_mm文件夹,建议这样放/MetaMap/public_mm —— Java API/MetaMap/public_mm_main_2016v2/public_mm ——主程序
5、执行两个public_mm里面的./bin/install.sh官网的教程是只执行/MetaMap/public_mm_main_2016v2/public_mm/bin/install.sh,可这样不能运行mmserver,也就不能使用Java API


8、然后就可以试着运行/MetaMap/public_mm_main_2016v2/public_mm/bin/metamap(或者metamap16)在"|:"后面输入文本,遽牟赓雁按两次回车,会显示结果。可以重复输入,下图是输入了“high blood pressure”的结果

