ClustalX+GeneDoc绘制多重序列比对图
多重序列比对是对三个以上的生物学序列所作的序列比对。利用ClustalX可以进行多重序列比对,结合GeneDoc可绘制出漂亮的多重序列比对图,满足高质量期刊的要求。
1、ClustalX进行多重序列比对
1、首先,打开ClustalX,依次在菜单栏选择“File”-“Load Sequences”导入我们的目的序列(fas格式)。

3、选择保存路径,点击“OK”。一般默认生成两个文件,分别是*.aln和*.dnd文件,可以用“记事本”打开。


2、点击“Project”-“Configure”,修改“Points”可以改字体大小,进而改变图片大小。

3、点击“Project”-“Edit Sequences List”,可以修改序列名称或者氨基酸序列的顺序。双击序列名称可以对其进行修改,“Move Up”和“Move Down”可以上下调整序列位置。

4、多重序列比对图片导出,点击“Edit”-“Select Blocks for Copy”。然后选择要导出的序列,序列背景变成黑色。

5、然后再点击 “Edit”-“Copy Select Blocks to”-“MetaFile”,即可直接复制得到多重序列比对的图片。

6、GeneDoc还可以对图片进行美化,具体操作以及其它功能将在接下来继续为大家整理。